La Giunta è un Organo esecutivo che coadiuva il Direttore.

Componenti di diritto della Giunta sono il Direttore, che la presiede, il Vicedirettore e il Responsabile Amministrativo, i Presidenti dei Collegi Didattici di Scienze Biologiche e di Biotecnologie, di cui il Dipartimento è Referente Principale, e il Presidente o il rappresentante del Collegio Didattico Interdipartimentale di Scienze Naturali. Ne fanno parte inoltre i Prorettori.

La componente elettiva della Giunta consta di 4 Professori di prima fascia, 4 Professori di seconda fascia, 4 Ricercatori a tempo indeterminato o a tempo determinato e 4 rappresentanti del Personale Tecnico e Amministrativo.